Existen pajonales, bosques enanos y bosques de neblina; se encuentran orquídeas de flores diminutas de extraordinaria belleza; y la vegetación arbórea está compuesta por muchas especies valiosas entre las que tenemos cascarilla (Cinchona sp.), cedro (Cedrela sp.), roble (Nectandra sp.), nogal (Juglans neotropica) y aliso (Alnus jorullensis).
La vegetación que predomina corresponde a la selva alta existen abundantes orquídeas, helechos, palmeras, cedros, alisos colorados, nogales de montaña, saucecillos, ishpingos, choloques y quinas que constituyen un verdadero paraíso botánico.
Instituciones especializadas calculan 125 familias, 340 géneros y 683 especies de flora en los dominios del parque.
Hay que destacar al árbol de la quina, que permitió la elaboración de la quinina para controlar la malaria en el mundo. La quina, es símbolo del escudo nacional, y se extrajo de este lugar… hoy es posible que esté extinta en este territorio.
Arbol de la Quina en Cutervo
Bosque de neblina
Una orquídea explota en color púrpura en una de las brumosas quebradas del parque
Zapatito de Reina, nombre común de la orquídea Phragmypedium caudatum.
Floración de la orquídea Maxillaria tenuis.
Epidendrum secundum, conocida en quechua como Wiñay Wayna (siempre jóven)
Masdevallia setacea, una de las orquídeas más abundantes en el perú.
roble(Quercus)
El nogal(Juglans regia)
aliso(Alnus acuminata)
Palmeras blancas