El CENAIM mantiene desde 1992 una estación semanal de monitoreo ambiental en las cercanías del islote El Pelado, ubicado a 5 millas frente a sus instalaciones en San Pedro de Manglaralto - Ecuador.

La estación realiza un seguimiento permanente de la estructura termohalina subsuperficial hasta 40 metros de profundidad, en una zona donde la interacción de varias masas de agua regulan el clima local en la distintas escalas de tiempo, inlfuenciando los ecosistemas marinos del área.